Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP6Q16828 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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