Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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