Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL15Q16663 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCL15Q16663 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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