Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms