Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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