Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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