Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCM1Q15154 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms