Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3GAP1Q15042 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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