Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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