Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCINQ13939 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCINQ13939 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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CCINQ13939 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCINQ13939 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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