Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms