Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CUL3Q13618 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CUL3Q13618 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CUL3Q13618 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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