Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX6Q13608 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms