Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms