Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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