Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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