Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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