Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA3FQ13275 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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