Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms