Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms