Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms