Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms