Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2B2Q01814 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms