Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms