Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms