Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL7P80098 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL7P80098 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL7P80098 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms