Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms