Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTBP60709 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms