Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms