Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A1P53007 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms