Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms