Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP153P49790 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP153P49790 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms