Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK1EP49674 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms