Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM4P49221 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms