Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD2P49005 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD2P49005 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD2P49005 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLD2P49005 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD2P49005 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD2P49005 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLD2P49005 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms