Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms