Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT5P48643 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT5P48643 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT5P48643 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms