Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFX3P48380 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFX3P48380 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFX3P48380 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFX3P48380 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFX3P48380 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFX3P48380 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms