Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IQGAP1P46940 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQGAP1P46940 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms