Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPD2P43304 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPD2P43304 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPD2P43304 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms