Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGER3P43115 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms