Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms