Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms