Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPS1P31327 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPS1P31327 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPS1P31327 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPS1P31327 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms