Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms