Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms