Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGS1P23219 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms