Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL1P22362 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL1P22362 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL1P22362 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms