Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAV1P15498 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms