Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms